Protein–RNA interactions for Protein: Q12888

TP53BP1, TP53-binding protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,972 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP53BP1Q12888 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TP53BP1Q12888 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TP53BP1Q12888 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TP53BP1Q12888 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
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