Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

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Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FOXO1Q12778 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FOXO1Q12778 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
FOXO1Q12778 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
FOXO1Q12778 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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