Protein–RNA interactions for Protein: Q12770

SCAP, Sterol regulatory element-binding protein cleavage-activating protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,279 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPQ12770 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SCAPQ12770 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCAPQ12770 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SCAPQ12770 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SCAPQ12770 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
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