Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC173Q0VFZ6 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC173Q0VFZ6 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
CCDC173Q0VFZ6 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC173Q0VFZ6 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms