Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NIPAL4Q0D2K0 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
NIPAL4Q0D2K0 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NIPAL4Q0D2K0 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms