Protein–RNA interactions for Protein: Q08AI8

C2orf54, Uncharacterized protein C2orf54, humanhuman

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C2orf54Q08AI8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
C2orf54Q08AI8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
C2orf54Q08AI8 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C2orf54Q08AI8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C2orf54Q08AI8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms