Protein–RNA interactions for Protein: Q08AE8

SPIRE1, Protein spire homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIRE1Q08AE8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SPIRE1Q08AE8 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SPIRE1Q08AE8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.83■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SPIRE1Q08AE8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SPIRE1Q08AE8 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms