Protein–RNA interactions for Protein: Q08345

DDR1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 913 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDR1Q08345 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
DDR1Q08345 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.26■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC30.21■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
DDR1Q08345 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
DDR1Q08345 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC30.12■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC30.11■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.1■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
DDR1Q08345 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms