Protein–RNA interactions for Protein: Q07325

CXCL9, C-X-C motif chemokine 9, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL9Q07325 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CXCL9Q07325 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CXCL9Q07325 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CXCL9Q07325 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC29■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC29■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CXCL9Q07325 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms