Protein–RNA interactions for Protein: Q05397

PTK2, Focal adhesion kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,052 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTK2Q05397 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.7■■□□□ 1.71
PTK2Q05397 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PTK2Q05397 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
PTK2Q05397 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms