Protein–RNA interactions for Protein: Q05209

PTPN12, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 780 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN12Q05209 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PTPN12Q05209 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.7■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PTPN12Q05209 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PTPN12Q05209 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PTPN12Q05209 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms