Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ATP7AQ04656 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.14■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC36.14■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC36.13■■■■□ 3.38
ATP7AQ04656 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC36.13■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
ATP7AQ04656 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
ATP7AQ04656 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
ATP7AQ04656 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
ATP7AQ04656 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ATP7AQ04656 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ATP7AQ04656 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ATP7AQ04656 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ATP7AQ04656 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
ATP7AQ04656 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ATP7AQ04656 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
ATP7AQ04656 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATP7AQ04656 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
ATP7AQ04656 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATP7AQ04656 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATP7AQ04656 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
ATP7AQ04656 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
ATP7AQ04656 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC36.02■■■■□ 3.36
ATP7AQ04656 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
ATP7AQ04656 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ATP7AQ04656 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
ATP7AQ04656 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC36■■■■□ 3.35
ATP7AQ04656 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
ATP7AQ04656 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms