Protein–RNA interactions for Protein: Q03395

ROM1, Rod outer segment membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROM1Q03395 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
ROM1Q03395 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ROM1Q03395 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ROM1Q03395 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms