Protein–RNA interactions for Protein: Q02539

HIST1H1A, Histone H1.1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST1H1AQ02539 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIST1H1AQ02539 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIST1H1AQ02539 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HIST1H1AQ02539 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIST1H1AQ02539 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIST1H1AQ02539 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIST1H1AQ02539 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HIST1H1AQ02539 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HIST1H1AQ02539 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HIST1H1AQ02539 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.2 ms