Protein–RNA interactions for Protein: Q02505

MUC3A, Mucin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 3,323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC3AQ02505 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
MUC3AQ02505 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
MUC3AQ02505 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MUC3AQ02505 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
MUC3AQ02505 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.3 ms