Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
XPCQ01831 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
XPCQ01831 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC33.1■■■□□ 2.89
XPCQ01831 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
XPCQ01831 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
XPCQ01831 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
XPCQ01831 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
XPCQ01831 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
XPCQ01831 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
XPCQ01831 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
XPCQ01831 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
XPCQ01831 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
XPCQ01831 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
XPCQ01831 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
XPCQ01831 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC33.08■■■□□ 2.89
XPCQ01831 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
XPCQ01831 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC33.08■■■□□ 2.89
XPCQ01831 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
XPCQ01831 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
XPCQ01831 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.89
XPCQ01831 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
XPCQ01831 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
XPCQ01831 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
XPCQ01831 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
XPCQ01831 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
XPCQ01831 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
XPCQ01831 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
XPCQ01831 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
XPCQ01831 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
XPCQ01831 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
XPCQ01831 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
XPCQ01831 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
XPCQ01831 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
XPCQ01831 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
XPCQ01831 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
XPCQ01831 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
XPCQ01831 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
XPCQ01831 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
XPCQ01831 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC33.02■■■□□ 2.88
XPCQ01831 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
XPCQ01831 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
XPCQ01831 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
XPCQ01831 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
XPCQ01831 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
XPCQ01831 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
XPCQ01831 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC33.01■■■□□ 2.87
XPCQ01831 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
XPCQ01831 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.01■■■□□ 2.87
XPCQ01831 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
XPCQ01831 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
XPCQ01831 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
XPCQ01831 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
XPCQ01831 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC33■■■□□ 2.87
XPCQ01831 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
XPCQ01831 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
XPCQ01831 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
XPCQ01831 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC32.99■■■□□ 2.87
XPCQ01831 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
XPCQ01831 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
XPCQ01831 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
XPCQ01831 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC32.99■■■□□ 2.87
XPCQ01831 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.98■■■□□ 2.87
XPCQ01831 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
XPCQ01831 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
XPCQ01831 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
XPCQ01831 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
XPCQ01831 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
XPCQ01831 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.97■■■□□ 2.87
XPCQ01831 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC32.96■■■□□ 2.87
XPCQ01831 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
XPCQ01831 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
XPCQ01831 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
XPCQ01831 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
XPCQ01831 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
XPCQ01831 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
XPCQ01831 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
XPCQ01831 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.86
XPCQ01831 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
XPCQ01831 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
XPCQ01831 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC32.94■■■□□ 2.86
XPCQ01831 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC32.93■■■□□ 2.86
XPCQ01831 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
XPCQ01831 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
XPCQ01831 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
XPCQ01831 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
XPCQ01831 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC32.92■■■□□ 2.86
XPCQ01831 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.92■■■□□ 2.86
XPCQ01831 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.91■■■□□ 2.86
XPCQ01831 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
XPCQ01831 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
XPCQ01831 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
XPCQ01831 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
XPCQ01831 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
XPCQ01831 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
XPCQ01831 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC32.9■■■□□ 2.86
XPCQ01831 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
XPCQ01831 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC32.89■■■□□ 2.86
XPCQ01831 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
XPCQ01831 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
XPCQ01831 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms