Protein–RNA interactions for Protein: Q01628

IFITM3, Interferon-induced transmembrane protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM3Q01628 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
IFITM3Q01628 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
IFITM3Q01628 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
IFITM3Q01628 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms