Protein–RNA interactions for Protein: P80303

NUCB2, Nucleobindin-2, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUCB2P80303 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
NUCB2P80303 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
NUCB2P80303 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
NUCB2P80303 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms