Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL7P80098 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL7P80098 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCL7P80098 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL7P80098 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL7P80098 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL7P80098 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL7P80098 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL7P80098 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCL7P80098 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCL7P80098 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL7P80098 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL7P80098 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL7P80098 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL7P80098 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL7P80098 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL7P80098 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL7P80098 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL7P80098 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL7P80098 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL7P80098 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCL7P80098 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL7P80098 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL7P80098 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL7P80098 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL7P80098 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCL7P80098 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL7P80098 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL7P80098 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL7P80098 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL7P80098 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL7P80098 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL7P80098 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL7P80098 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL7P80098 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL7P80098 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL7P80098 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCL7P80098 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL7P80098 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCL7P80098 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL7P80098 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL7P80098 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL7P80098 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL7P80098 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL7P80098 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL7P80098 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL7P80098 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCL7P80098 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL7P80098 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL7P80098 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL7P80098 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL7P80098 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL7P80098 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL7P80098 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL7P80098 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL7P80098 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CCL7P80098 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL7P80098 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL7P80098 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL7P80098 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL7P80098 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL7P80098 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL7P80098 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL7P80098 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL7P80098 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL7P80098 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL7P80098 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CCL7P80098 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CCL7P80098 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL7P80098 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCL7P80098 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCL7P80098 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL7P80098 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL7P80098 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL7P80098 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL7P80098 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL7P80098 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CCL7P80098 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL7P80098 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL7P80098 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL7P80098 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL7P80098 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL7P80098 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCL7P80098 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL7P80098 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL7P80098 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL7P80098 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL7P80098 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL7P80098 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCL7P80098 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL7P80098 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL7P80098 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CCL7P80098 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL7P80098 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL7P80098 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL7P80098 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL7P80098 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL7P80098 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL7P80098 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
CCL7P80098 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 128.4 ms