Protein–RNA interactions for Protein: P78369

CLDN10, Claudin-10, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN10P78369 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CLDN10P78369 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CLDN10P78369 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CLDN10P78369 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN10P78369 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN10P78369 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN10P78369 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN10P78369 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN10P78369 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN10P78369 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN10P78369 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CLDN10P78369 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN10P78369 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN10P78369 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN10P78369 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN10P78369 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN10P78369 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN10P78369 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN10P78369 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN10P78369 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN10P78369 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CLDN10P78369 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms