Protein–RNA interactions for Protein: P68366

TUBA4A, Tubulin alpha-4A chain, humanhuman

Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA4AP68366 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TUBA4AP68366 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TUBA4AP68366 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TUBA4AP68366 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms