Protein–RNA interactions for Protein: P61201

COPS2, COP9 signalosome complex subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS2P61201 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPS2P61201 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPS2P61201 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPS2P61201 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPS2P61201 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
COPS2P61201 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS2P61201 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS2P61201 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS2P61201 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS2P61201 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS2P61201 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS2P61201 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS2P61201 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
COPS2P61201 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS2P61201 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS2P61201 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS2P61201 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS2P61201 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS2P61201 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS2P61201 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS2P61201 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS2P61201 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
COPS2P61201 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS2P61201 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS2P61201 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
COPS2P61201 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
COPS2P61201 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS2P61201 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS2P61201 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS2P61201 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS2P61201 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS2P61201 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS2P61201 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS2P61201 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
COPS2P61201 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS2P61201 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS2P61201 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS2P61201 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS2P61201 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
COPS2P61201 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS2P61201 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS2P61201 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS2P61201 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
COPS2P61201 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS2P61201 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
COPS2P61201 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPS2P61201 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPS2P61201 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPS2P61201 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
COPS2P61201 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPS2P61201 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPS2P61201 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPS2P61201 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
COPS2P61201 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COPS2P61201 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPS2P61201 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
COPS2P61201 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPS2P61201 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPS2P61201 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
COPS2P61201 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPS2P61201 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPS2P61201 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPS2P61201 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
COPS2P61201 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPS2P61201 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPS2P61201 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
COPS2P61201 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS2P61201 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS2P61201 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS2P61201 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS2P61201 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS2P61201 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS2P61201 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS2P61201 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS2P61201 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
COPS2P61201 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPS2P61201 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPS2P61201 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPS2P61201 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPS2P61201 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
COPS2P61201 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS2P61201 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS2P61201 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS2P61201 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS2P61201 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS2P61201 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS2P61201 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS2P61201 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS2P61201 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
COPS2P61201 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPS2P61201 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPS2P61201 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPS2P61201 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPS2P61201 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPS2P61201 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPS2P61201 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPS2P61201 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPS2P61201 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
COPS2P61201 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
COPS2P61201 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.9 ms