Protein–RNA interactions for Protein: P56915

GSC, Homeobox protein goosecoid, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSCP56915 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSCP56915 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSCP56915 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
GSCP56915 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSCP56915 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GSCP56915 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSCP56915 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSCP56915 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSCP56915 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSCP56915 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GSCP56915 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSCP56915 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSCP56915 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GSCP56915 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSCP56915 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSCP56915 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSCP56915 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GSCP56915 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSCP56915 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSCP56915 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSCP56915 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSCP56915 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSCP56915 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GSCP56915 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSCP56915 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSCP56915 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSCP56915 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSCP56915 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GSCP56915 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSCP56915 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSCP56915 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSCP56915 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSCP56915 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSCP56915 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSCP56915 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GSCP56915 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSCP56915 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSCP56915 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
GSCP56915 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GSCP56915 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSCP56915 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GSCP56915 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
GSCP56915 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSCP56915 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSCP56915 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSCP56915 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GSCP56915 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSCP56915 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSCP56915 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSCP56915 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSCP56915 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GSCP56915 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSCP56915 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSCP56915 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSCP56915 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSCP56915 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSCP56915 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSCP56915 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSCP56915 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSCP56915 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSCP56915 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GSCP56915 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSCP56915 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSCP56915 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSCP56915 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSCP56915 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSCP56915 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GSCP56915 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSCP56915 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSCP56915 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSCP56915 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSCP56915 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSCP56915 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSCP56915 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GSCP56915 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSCP56915 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSCP56915 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSCP56915 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSCP56915 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSCP56915 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GSCP56915 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSCP56915 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSCP56915 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSCP56915 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSCP56915 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSCP56915 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GSCP56915 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GSCP56915 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GSCP56915 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GSCP56915 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSCP56915 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSCP56915 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSCP56915 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GSCP56915 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GSCP56915 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSCP56915 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSCP56915 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSCP56915 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GSCP56915 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GSCP56915 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 188.1 ms