Protein–RNA interactions for Protein: P56817

BACE1, Beta-secretase 1, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BACE1P56817 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
BACE1P56817 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
BACE1P56817 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BACE1P56817 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BACE1P56817 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BACE1P56817 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BACE1P56817 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
BACE1P56817 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
BACE1P56817 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BACE1P56817 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BACE1P56817 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BACE1P56817 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BACE1P56817 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
BACE1P56817 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BACE1P56817 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BACE1P56817 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BACE1P56817 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BACE1P56817 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BACE1P56817 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BACE1P56817 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BACE1P56817 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
BACE1P56817 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BACE1P56817 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
BACE1P56817 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
BACE1P56817 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BACE1P56817 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
BACE1P56817 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
BACE1P56817 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BACE1P56817 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BACE1P56817 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
BACE1P56817 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BACE1P56817 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
BACE1P56817 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BACE1P56817 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BACE1P56817 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
BACE1P56817 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BACE1P56817 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BACE1P56817 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
BACE1P56817 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BACE1P56817 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BACE1P56817 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BACE1P56817 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
BACE1P56817 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BACE1P56817 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
BACE1P56817 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BACE1P56817 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BACE1P56817 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BACE1P56817 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BACE1P56817 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BACE1P56817 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
BACE1P56817 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BACE1P56817 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BACE1P56817 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BACE1P56817 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BACE1P56817 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BACE1P56817 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BACE1P56817 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BACE1P56817 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
BACE1P56817 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BACE1P56817 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BACE1P56817 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BACE1P56817 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BACE1P56817 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BACE1P56817 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BACE1P56817 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BACE1P56817 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
BACE1P56817 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BACE1P56817 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BACE1P56817 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BACE1P56817 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BACE1P56817 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BACE1P56817 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BACE1P56817 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BACE1P56817 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BACE1P56817 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BACE1P56817 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BACE1P56817 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BACE1P56817 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BACE1P56817 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BACE1P56817 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BACE1P56817 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BACE1P56817 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BACE1P56817 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BACE1P56817 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BACE1P56817 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BACE1P56817 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BACE1P56817 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BACE1P56817 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BACE1P56817 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BACE1P56817 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BACE1P56817 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BACE1P56817 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BACE1P56817 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BACE1P56817 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BACE1P56817 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
BACE1P56817 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BACE1P56817 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BACE1P56817 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BACE1P56817 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BACE1P56817 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms