Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP1S2P56377 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
AP1S2P56377 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
AP1S2P56377 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
AP1S2P56377 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
AP1S2P56377 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms