Protein–RNA interactions for Protein: P56159

GFRA1, GDNF family receptor alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA1P56159 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
GFRA1P56159 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
GFRA1P56159 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
GFRA1P56159 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms