Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH15P55291 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH15P55291 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH15P55291 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH15P55291 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH15P55291 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH15P55291 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH15P55291 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH15P55291 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH15P55291 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH15P55291 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH15P55291 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH15P55291 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH15P55291 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH15P55291 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH15P55291 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH15P55291 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH15P55291 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH15P55291 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH15P55291 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH15P55291 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH15P55291 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH15P55291 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH15P55291 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH15P55291 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
CDH15P55291 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH15P55291 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH15P55291 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH15P55291 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH15P55291 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH15P55291 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH15P55291 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CDH15P55291 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH15P55291 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH15P55291 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH15P55291 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH15P55291 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH15P55291 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH15P55291 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH15P55291 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH15P55291 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH15P55291 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH15P55291 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CDH15P55291 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH15P55291 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH15P55291 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH15P55291 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH15P55291 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CDH15P55291 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH15P55291 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH15P55291 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH15P55291 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH15P55291 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH15P55291 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH15P55291 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH15P55291 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH15P55291 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH15P55291 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH15P55291 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CDH15P55291 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH15P55291 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH15P55291 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH15P55291 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH15P55291 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH15P55291 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH15P55291 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH15P55291 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CDH15P55291 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH15P55291 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH15P55291 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH15P55291 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH15P55291 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH15P55291 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH15P55291 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH15P55291 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH15P55291 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH15P55291 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH15P55291 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH15P55291 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH15P55291 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CDH15P55291 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CDH15P55291 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH15P55291 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH15P55291 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH15P55291 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH15P55291 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH15P55291 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH15P55291 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CDH15P55291 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH15P55291 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH15P55291 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH15P55291 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH15P55291 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH15P55291 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH15P55291 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CDH15P55291 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CDH15P55291 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CDH15P55291 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH15P55291 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CDH15P55291 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 114.9 ms