Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB3P54753 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB3P54753 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB3P54753 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB3P54753 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
EPHB3P54753 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB3P54753 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB3P54753 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB3P54753 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB3P54753 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB3P54753 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB3P54753 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB3P54753 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
EPHB3P54753 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB3P54753 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
EPHB3P54753 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
EPHB3P54753 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
EPHB3P54753 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
EPHB3P54753 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms