Protein–RNA interactions for Protein: P54278

PMS2, Mismatch repair endonuclease PMS2, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMS2P54278 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P54278 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P54278 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P54278 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PMS2P54278 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMS2P54278 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMS2P54278 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMS2P54278 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PMS2P54278 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS2P54278 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS2P54278 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS2P54278 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS2P54278 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS2P54278 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS2P54278 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS2P54278 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS2P54278 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS2P54278 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS2P54278 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PMS2P54278 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS2P54278 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS2P54278 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS2P54278 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS2P54278 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS2P54278 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS2P54278 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS2P54278 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PMS2P54278 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS2P54278 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS2P54278 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS2P54278 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PMS2P54278 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS2P54278 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS2P54278 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS2P54278 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS2P54278 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS2P54278 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PMS2P54278 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS2P54278 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS2P54278 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS2P54278 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS2P54278 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS2P54278 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS2P54278 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PMS2P54278 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P54278 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P54278 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P54278 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P54278 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P54278 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P54278 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P54278 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P54278 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P54278 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P54278 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P54278 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P54278 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PMS2P54278 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMS2P54278 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMS2P54278 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMS2P54278 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMS2P54278 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMS2P54278 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMS2P54278 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PMS2P54278 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS2P54278 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS2P54278 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS2P54278 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS2P54278 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS2P54278 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PMS2P54278 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS2P54278 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS2P54278 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS2P54278 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS2P54278 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PMS2P54278 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PMS2P54278 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PMS2P54278 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PMS2P54278 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PMS2P54278 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS2P54278 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS2P54278 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS2P54278 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS2P54278 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS2P54278 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS2P54278 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS2P54278 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PMS2P54278 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS2P54278 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS2P54278 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PMS2P54278 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS2P54278 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS2P54278 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS2P54278 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS2P54278 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS2P54278 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS2P54278 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PMS2P54278 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS2P54278 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PMS2P54278 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms