Protein–RNA interactions for Protein: P54252

ATXN3, Ataxin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN3P54252 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ATXN3P54252 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ATXN3P54252 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ATXN3P54252 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms