Protein–RNA interactions for Protein: P54105

CLNS1A, Methylosome subunit pICln, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLNS1AP54105 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
CLNS1AP54105 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CLNS1AP54105 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CLNS1AP54105 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms