Protein–RNA interactions for Protein: P53803

POLR2K, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 58 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2KP53803 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
POLR2KP53803 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
POLR2KP53803 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
POLR2KP53803 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.8 ms