Protein–RNA interactions for Protein: P53794

SLC5A3, Sodium/myo-inositol cotransporter, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC5A3P53794 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC5A3P53794 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC5A3P53794 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC5A3P53794 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms