Protein–RNA interactions for Protein: P53602

MVD, Diphosphomevalonate decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MVDP53602 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MVDP53602 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MVDP53602 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MVDP53602 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MVDP53602 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MVDP53602 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MVDP53602 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MVDP53602 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MVDP53602 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MVDP53602 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MVDP53602 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MVDP53602 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MVDP53602 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MVDP53602 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MVDP53602 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MVDP53602 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MVDP53602 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
MVDP53602 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MVDP53602 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MVDP53602 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MVDP53602 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MVDP53602 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MVDP53602 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MVDP53602 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MVDP53602 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MVDP53602 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MVDP53602 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MVDP53602 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MVDP53602 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MVDP53602 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MVDP53602 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MVDP53602 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MVDP53602 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MVDP53602 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MVDP53602 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MVDP53602 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MVDP53602 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MVDP53602 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MVDP53602 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MVDP53602 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MVDP53602 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MVDP53602 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MVDP53602 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MVDP53602 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MVDP53602 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
MVDP53602 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
MVDP53602 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MVDP53602 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
MVDP53602 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MVDP53602 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MVDP53602 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MVDP53602 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MVDP53602 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MVDP53602 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
MVDP53602 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MVDP53602 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
MVDP53602 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MVDP53602 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MVDP53602 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MVDP53602 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MVDP53602 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MVDP53602 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
MVDP53602 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MVDP53602 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MVDP53602 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
MVDP53602 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MVDP53602 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
MVDP53602 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
MVDP53602 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MVDP53602 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MVDP53602 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MVDP53602 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
MVDP53602 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVDP53602 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVDP53602 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVDP53602 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVDP53602 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVDP53602 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVDP53602 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVDP53602 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVDP53602 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVDP53602 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVDP53602 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVDP53602 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
MVDP53602 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MVDP53602 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MVDP53602 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
MVDP53602 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MVDP53602 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MVDP53602 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MVDP53602 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MVDP53602 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MVDP53602 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MVDP53602 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MVDP53602 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MVDP53602 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
MVDP53602 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
MVDP53602 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MVDP53602 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
MVDP53602 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.1 ms