Protein–RNA interactions for Protein: P53384

NUBP1, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP1, humanhuman

Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP1P53384 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
NUBP1P53384 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NUBP1P53384 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NUBP1P53384 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NUBP1P53384 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms