Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDST2P52849 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDST2P52849 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDST2P52849 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDST2P52849 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NDST2P52849 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDST2P52849 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDST2P52849 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDST2P52849 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NDST2P52849 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
NDST2P52849 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NDST2P52849 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDST2P52849 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
NDST2P52849 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDST2P52849 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDST2P52849 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDST2P52849 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDST2P52849 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDST2P52849 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDST2P52849 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NDST2P52849 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDST2P52849 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NDST2P52849 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDST2P52849 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDST2P52849 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDST2P52849 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
NDST2P52849 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDST2P52849 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDST2P52849 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDST2P52849 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NDST2P52849 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDST2P52849 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NDST2P52849 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDST2P52849 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDST2P52849 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDST2P52849 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDST2P52849 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDST2P52849 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NDST2P52849 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDST2P52849 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
NDST2P52849 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDST2P52849 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDST2P52849 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDST2P52849 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDST2P52849 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDST2P52849 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NDST2P52849 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDST2P52849 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NDST2P52849 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NDST2P52849 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDST2P52849 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDST2P52849 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NDST2P52849 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDST2P52849 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDST2P52849 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDST2P52849 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDST2P52849 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDST2P52849 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDST2P52849 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDST2P52849 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NDST2P52849 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDST2P52849 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDST2P52849 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDST2P52849 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDST2P52849 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDST2P52849 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDST2P52849 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NDST2P52849 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDST2P52849 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDST2P52849 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDST2P52849 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDST2P52849 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDST2P52849 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDST2P52849 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDST2P52849 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NDST2P52849 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDST2P52849 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDST2P52849 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDST2P52849 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDST2P52849 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDST2P52849 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDST2P52849 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
NDST2P52849 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDST2P52849 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NDST2P52849 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDST2P52849 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDST2P52849 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDST2P52849 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDST2P52849 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
NDST2P52849 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST2P52849 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST2P52849 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST2P52849 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST2P52849 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST2P52849 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST2P52849 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST2P52849 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NDST2P52849 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDST2P52849 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
NDST2P52849 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms