Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
ZNF138P52744 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
ZNF138P52744 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms