Protein–RNA interactions for Protein: P52738

ZNF140, Zinc finger protein 140, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF140P52738 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
ZNF140P52738 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
ZNF140P52738 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF140P52738 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF140P52738 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF140P52738 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF140P52738 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
ZNF140P52738 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF140P52738 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF140P52738 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF140P52738 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF140P52738 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF140P52738 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF140P52738 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ZNF140P52738 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF140P52738 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF140P52738 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF140P52738 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF140P52738 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ZNF140P52738 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms