Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSR4P51571 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSR4P51571 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SSR4P51571 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSR4P51571 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SSR4P51571 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR4P51571 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR4P51571 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR4P51571 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR4P51571 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR4P51571 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR4P51571 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SSR4P51571 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR4P51571 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR4P51571 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR4P51571 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR4P51571 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR4P51571 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR4P51571 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR4P51571 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR4P51571 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR4P51571 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR4P51571 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR4P51571 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR4P51571 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SSR4P51571 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR4P51571 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR4P51571 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR4P51571 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR4P51571 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR4P51571 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR4P51571 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR4P51571 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR4P51571 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SSR4P51571 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR4P51571 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR4P51571 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR4P51571 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR4P51571 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR4P51571 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR4P51571 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR4P51571 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR4P51571 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR4P51571 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SSR4P51571 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SSR4P51571 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SSR4P51571 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR4P51571 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR4P51571 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR4P51571 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR4P51571 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR4P51571 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR4P51571 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SSR4P51571 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR4P51571 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR4P51571 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR4P51571 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SSR4P51571 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR4P51571 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR4P51571 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR4P51571 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR4P51571 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR4P51571 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SSR4P51571 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR4P51571 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR4P51571 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR4P51571 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR4P51571 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR4P51571 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR4P51571 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR4P51571 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR4P51571 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR4P51571 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR4P51571 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR4P51571 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SSR4P51571 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR4P51571 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SSR4P51571 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR4P51571 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR4P51571 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR4P51571 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR4P51571 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR4P51571 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR4P51571 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR4P51571 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR4P51571 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR4P51571 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SSR4P51571 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SSR4P51571 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR4P51571 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR4P51571 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR4P51571 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR4P51571 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR4P51571 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR4P51571 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SSR4P51571 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR4P51571 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR4P51571 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR4P51571 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SSR4P51571 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.7 ms