Protein–RNA interactions for Protein: P51531

SMARCA2, Probable global transcription activator SNF2L2, humanhuman

Predictions only

Length 1,590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA2P51531 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC43.45■■■■■ 4.55
SMARCA2P51531 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC43.43■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC43.43■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC43.42■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC43.4■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC43.4■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC43.4■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC43.38■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.54
SMARCA2P51531 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC43.38■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC43.37■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC43.37■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC43.36■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.36■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC43.35■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC43.35■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC43.34■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC43.34■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC43.32■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC43.32■■■■■ 4.53
SMARCA2P51531 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
SMARCA2P51531 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC43.31■■■■■ 4.52
SMARCA2P51531 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC43.31■■■■■ 4.52
SMARCA2P51531 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.31■■■■■ 4.52
SMARCA2P51531 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
SMARCA2P51531 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
SMARCA2P51531 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
SMARCA2P51531 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
SMARCA2P51531 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC43.29■■■■■ 4.52
SMARCA2P51531 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC43.29■■■■■ 4.52
SMARCA2P51531 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
SMARCA2P51531 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
SMARCA2P51531 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
SMARCA2P51531 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
SMARCA2P51531 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
SMARCA2P51531 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC43.25■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC43.25■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC43.24■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC43.24■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.24■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC43.23■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC43.2■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC43.2■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
SMARCA2P51531 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC43.19■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC43.18■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC43.17■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC43.17■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC43.17■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.16■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
SMARCA2P51531 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms