Protein–RNA interactions for Protein: P49761

CLK3, Dual specificity protein kinase CLK3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK3P49761 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK3P49761 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK3P49761 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK3P49761 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CLK3P49761 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK3P49761 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK3P49761 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK3P49761 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK3P49761 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK3P49761 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK3P49761 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK3P49761 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK3P49761 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CLK3P49761 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK3P49761 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK3P49761 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK3P49761 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK3P49761 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
CLK3P49761 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK3P49761 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK3P49761 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK3P49761 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK3P49761 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK3P49761 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK3P49761 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK3P49761 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK3P49761 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK3P49761 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK3P49761 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK3P49761 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK3P49761 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK3P49761 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CLK3P49761 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK3P49761 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK3P49761 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK3P49761 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK3P49761 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK3P49761 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK3P49761 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK3P49761 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CLK3P49761 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CLK3P49761 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CLK3P49761 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK3P49761 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK3P49761 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK3P49761 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK3P49761 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK3P49761 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK3P49761 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK3P49761 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK3P49761 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK3P49761 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK3P49761 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK3P49761 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CLK3P49761 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK3P49761 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK3P49761 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK3P49761 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK3P49761 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK3P49761 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK3P49761 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK3P49761 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK3P49761 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK3P49761 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK3P49761 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK3P49761 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
CLK3P49761 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK3P49761 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK3P49761 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK3P49761 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK3P49761 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK3P49761 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK3P49761 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK3P49761 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK3P49761 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK3P49761 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK3P49761 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK3P49761 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK3P49761 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CLK3P49761 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK3P49761 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK3P49761 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK3P49761 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK3P49761 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK3P49761 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK3P49761 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK3P49761 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK3P49761 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CLK3P49761 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK3P49761 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK3P49761 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK3P49761 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK3P49761 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK3P49761 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
CLK3P49761 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK3P49761 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CLK3P49761 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLK3P49761 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLK3P49761 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CLK3P49761 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms