Protein–RNA interactions for Protein: P49721

PSMB2, Proteasome subunit beta type-2, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB2P49721 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
PSMB2P49721 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
PSMB2P49721 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
PSMB2P49721 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms