Protein–RNA interactions for Protein: P49585

PCYT1A, Choline-phosphate cytidylyltransferase A, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1AP49585 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCYT1AP49585 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCYT1AP49585 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PCYT1AP49585 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCYT1AP49585 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PCYT1AP49585 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCYT1AP49585 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCYT1AP49585 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCYT1AP49585 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCYT1AP49585 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCYT1AP49585 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCYT1AP49585 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PCYT1AP49585 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCYT1AP49585 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PCYT1AP49585 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
PCYT1AP49585 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCYT1AP49585 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PCYT1AP49585 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms