Protein–RNA interactions for Protein: P48165

GJA8, Gap junction alpha-8 protein, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA8P48165 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GJA8P48165 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJA8P48165 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJA8P48165 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJA8P48165 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJA8P48165 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GJA8P48165 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GJA8P48165 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GJA8P48165 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GJA8P48165 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GJA8P48165 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GJA8P48165 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GJA8P48165 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA8P48165 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA8P48165 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA8P48165 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA8P48165 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA8P48165 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA8P48165 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA8P48165 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA8P48165 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA8P48165 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA8P48165 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GJA8P48165 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA8P48165 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA8P48165 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA8P48165 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA8P48165 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA8P48165 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA8P48165 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA8P48165 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA8P48165 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA8P48165 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GJA8P48165 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJA8P48165 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GJA8P48165 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
GJA8P48165 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJA8P48165 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJA8P48165 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJA8P48165 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
GJA8P48165 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA8P48165 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA8P48165 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA8P48165 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA8P48165 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA8P48165 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA8P48165 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
GJA8P48165 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA8P48165 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA8P48165 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA8P48165 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
GJA8P48165 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJA8P48165 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJA8P48165 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJA8P48165 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJA8P48165 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJA8P48165 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
GJA8P48165 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJA8P48165 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJA8P48165 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
GJA8P48165 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJA8P48165 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
GJA8P48165 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA8P48165 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA8P48165 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA8P48165 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA8P48165 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA8P48165 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
GJA8P48165 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJA8P48165 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJA8P48165 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJA8P48165 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJA8P48165 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJA8P48165 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
GJA8P48165 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
GJA8P48165 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
GJA8P48165 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA8P48165 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA8P48165 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA8P48165 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA8P48165 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC26.88■■□□□ 1.89
GJA8P48165 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA8P48165 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA8P48165 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA8P48165 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA8P48165 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA8P48165 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA8P48165 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA8P48165 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA8P48165 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA8P48165 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA8P48165 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
GJA8P48165 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
GJA8P48165 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJA8P48165 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJA8P48165 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
GJA8P48165 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
GJA8P48165 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GJA8P48165 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
GJA8P48165 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms