Protein–RNA interactions for Protein: P46776

RPL27A, 60S ribosomal protein L27a, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27AP46776 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL27AP46776 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL27AP46776 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL27AP46776 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL27AP46776 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL27AP46776 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RPL27AP46776 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL27AP46776 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL27AP46776 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL27AP46776 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL27AP46776 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL27AP46776 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL27AP46776 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL27AP46776 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
RPL27AP46776 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
RPL27AP46776 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
RPL27AP46776 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.4 ms