Protein–RNA interactions for Protein: P43235

CTSK, Cathepsin K, humanhuman

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSKP43235 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSKP43235 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSKP43235 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSKP43235 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSKP43235 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSKP43235 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
CTSKP43235 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSKP43235 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSKP43235 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSKP43235 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSKP43235 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSKP43235 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
CTSKP43235 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSKP43235 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSKP43235 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSKP43235 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSKP43235 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSKP43235 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSKP43235 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
CTSKP43235 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSKP43235 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSKP43235 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSKP43235 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSKP43235 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSKP43235 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSKP43235 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSKP43235 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSKP43235 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSKP43235 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
CTSKP43235 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSKP43235 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSKP43235 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSKP43235 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSKP43235 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSKP43235 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
CTSKP43235 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSKP43235 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSKP43235 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSKP43235 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSKP43235 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSKP43235 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSKP43235 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSKP43235 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSKP43235 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
CTSKP43235 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSKP43235 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSKP43235 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSKP43235 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSKP43235 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSKP43235 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSKP43235 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSKP43235 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSKP43235 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSKP43235 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
CTSKP43235 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSKP43235 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSKP43235 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSKP43235 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSKP43235 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSKP43235 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSKP43235 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
CTSKP43235 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
CTSKP43235 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSKP43235 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSKP43235 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
CTSKP43235 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSKP43235 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSKP43235 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSKP43235 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
CTSKP43235 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSKP43235 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSKP43235 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSKP43235 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSKP43235 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSKP43235 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSKP43235 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSKP43235 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSKP43235 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSKP43235 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
CTSKP43235 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSKP43235 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSKP43235 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSKP43235 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSKP43235 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSKP43235 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSKP43235 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
CTSKP43235 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSKP43235 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSKP43235 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSKP43235 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSKP43235 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSKP43235 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSKP43235 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSKP43235 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSKP43235 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSKP43235 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSKP43235 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSKP43235 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CTSKP43235 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CTSKP43235 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms