Protein–RNA interactions for Protein: P43003

SLC1A3, Excitatory amino acid transporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A3P43003 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A3P43003 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A3P43003 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SLC1A3P43003 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A3P43003 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A3P43003 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A3P43003 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A3P43003 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A3P43003 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC1A3P43003 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC1A3P43003 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC1A3P43003 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC1A3P43003 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.8 ms