Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSG1P42857 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSG1P42857 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSG1P42857 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSG1P42857 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NSG1P42857 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSG1P42857 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSG1P42857 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NSG1P42857 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
NSG1P42857 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
NSG1P42857 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSG1P42857 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSG1P42857 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSG1P42857 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSG1P42857 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSG1P42857 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSG1P42857 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
NSG1P42857 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSG1P42857 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSG1P42857 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSG1P42857 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSG1P42857 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSG1P42857 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSG1P42857 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSG1P42857 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSG1P42857 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
NSG1P42857 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSG1P42857 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSG1P42857 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSG1P42857 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
NSG1P42857 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
NSG1P42857 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NSG1P42857 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
NSG1P42857 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSG1P42857 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSG1P42857 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSG1P42857 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSG1P42857 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSG1P42857 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSG1P42857 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
NSG1P42857 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSG1P42857 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSG1P42857 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSG1P42857 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSG1P42857 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
NSG1P42857 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSG1P42857 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSG1P42857 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSG1P42857 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
NSG1P42857 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSG1P42857 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSG1P42857 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSG1P42857 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSG1P42857 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
NSG1P42857 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSG1P42857 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSG1P42857 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSG1P42857 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
NSG1P42857 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSG1P42857 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSG1P42857 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSG1P42857 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
NSG1P42857 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSG1P42857 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSG1P42857 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSG1P42857 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NSG1P42857 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
NSG1P42857 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSG1P42857 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSG1P42857 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSG1P42857 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSG1P42857 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NSG1P42857 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSG1P42857 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSG1P42857 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSG1P42857 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSG1P42857 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NSG1P42857 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
NSG1P42857 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSG1P42857 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSG1P42857 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSG1P42857 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NSG1P42857 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSG1P42857 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSG1P42857 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSG1P42857 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NSG1P42857 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
NSG1P42857 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSG1P42857 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSG1P42857 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSG1P42857 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NSG1P42857 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSG1P42857 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSG1P42857 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSG1P42857 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSG1P42857 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSG1P42857 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSG1P42857 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
NSG1P42857 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NSG1P42857 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 346 ms