Protein–RNA interactions for Protein: P42262

GRIA2, Glutamate receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA2P42262 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
GRIA2P42262 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
GRIA2P42262 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
GRIA2P42262 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
GRIA2P42262 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms