Protein–RNA interactions for Protein: P41273

TNFSF9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF9P41273 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
TNFSF9P41273 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
TNFSF9P41273 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
TNFSF9P41273 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
TNFSF9P41273 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms